Une expertise de 20 ans dans les services omiques et les analyses pharmacogénomiques

Au cours de ses activités de R&D et de services, ACOBIOM a identifié des dizaines de biomarqueurs en corrélation avec le pronostic des maladies, l’efficacité des médicaments et la détection précoce de pathologies. Ces marqueurs ont été identifiés dans différents types de tissus, d’organes, et pour des questions biologiques spécifiques (telles que les pathologies, les effets des médicaments, etc.).

La société ACOBIOM a développé sa plateforme technologique d’analyse de l’ARN et de l’ADN basée sur des techniques de séquençage à haut débit. Ces technologies d’analyse sont capables d’identifier et de quantifier des acides nucléiques extrêmement spécifiques présents dans la cellule. Cela inclut notamment tous les types d’ARN codants (ARNm) et d’ARN non codants (petits ARN, pseudogènes, etc.).

Afin de traiter et d’analyser les millions de données générées par les séquenceurs haut-débit, ACOBIOM utilise ses propres programmes et bases de données bioinformatiques, ainsi que des algorithmes biostatistiques spécifiquement développés pour l’étude des données en question, et conçus pour l’analyse intégrée de l’information biologique.

Cette approche permet d’optimiser l’interprétation et de s’assurer qu’elle a un sens biologique.

Services pharmacogénomiques

ACOBIOM a développé des services en pharmacogénomique basés sur les technologies NGS et PCR et sa grande expérience est en mesure de supporter les acteurs pharmaceutiques pour optimiser les essais cliniques.

L’objectif de l’analyse pharmacogénomique clinique, qui permet également d’optimiser le design des essais cliniques, est de faciliter l’évaluation de certains paramètres pharmacologiques cliniques tels que :

• Réponse à la dose
• Efficacité du traitement
• Mesure des effets du médicament
• Sécurité – Toxicité – effets indésirables

ACOBIOM bénéficie d’une expérience significative dans le développement de médicaments et les essais cliniques. Ainsi, la société a participé à des essais cliniques de phase III pour des applications en oncologie et dans les maladies neurodégénératives, et a collaboré avec des équipes universitaires pour identifier et valider des biomarqueurs sanguins impliqués dans l’abus de médicaments EPO.

Séquençage

L’utilisation des méthodes de profilage de l’expression des gènes pour déchiffrer les états cellulaires associés aux maladies, aux tumeurs et à l’exposition aux agents environnementaux a démontré son efficacité et sa pertinence au cours des dernières années. Actuellement, l’avènement des approches de séquençage de nouvelle génération (NGS) a offert des outils révolutionnaires pour étudier la complexité du transcriptome.

ACOBIOM offre une gamme complète de services de séquençage de nouvelle génération en utilisant des plateformes appropriées selon le projet et l’équipe de biologistes et de bio-informaticiens pour fournir des résultats fiables et de haute qualité.

PCR en temps-réel

La réaction en chaîne par polymérase (PCR) est devenue l’un des outils les plus importants du diagnostic moléculaire, offrant une sensibilité et une spécificité optimales pour la détection de cibles d’acides nucléiques.

La PCR quantitative en temps réel (qPCR/qRT-PCR) est rapidement devenue une pratique standard, qui fournit une mesure sensible et reproductible de l’expression relative des gènes en comparant un ou plusieurs gènes d’intérêt à un contrôle interne connu pour la normalisation.

ACOBIOM offre des services d’analyse de l’expression des gènes, y compris l’analyse quantitative de l’expression (qPCR) pour des ensembles de transcriptions ciblés et adapte la plateforme PCR utilisée aux besoins de ses partenaires et clients, en fonction de la rapidité d’acquisition des données, de la flexibilité expérimentale et des traitements statistiques.

Services personnalisés

Depuis sa création, ACOBIOM analyse, identifie et valide des biomarqueurs omiques (ADN, ARN, miRNA…) en utilisant une gamme de technologies de biologie moléculaire (séquençage, NGS, PCR en temps réel) combinées à des outils bioinformatiques et biostatistiques dédiés.

L’expertise d’ACOBIOM en génomique et transcriptomique et son savoir-faire en analyse de données omiques lui permettent de fournir une gamme de services omiques pour identifier et/ou valider des biomarqueurs dans les domaines de la médecine translationnelle et de la recherche en sciences de la vie.

Ainsi, ACOBIOM fournit plusieurs services tels que :

• Analyse du transcriptome basée sur le séquençage (RNA-Seq)
• Séquençage du génome entier, séquençage de novo du génome, re-séquençage…
• Séquençage ciblé de régions génomiques d’intérêt,
• Séquençage et analyse de l’exome,
• PCR en temps réel pour l’analyse de l’expression des gènes
• Analyses épigénomiques : analyse du méthylome, CHIP-Seq…
• Analyses métagénomiques : Profilage du microbiome…
• Génotypage / génotypage ciblé…
• Analyses microbiologiques

dans tout domaine d’investigation :

• Exposition aux médicaments et variabilité de la réponse clinique
• Risque d’effets indésirables
• Dosage spécifique au génotype
• Mécanismes d’action des médicaments
• Gènes polymorphes de la cible et de la disposition du médicament
• Exposition à des agents pathogènes (virus, bactéries…)
• Interactions hôte-pathogène

sur tout type de cellules, tissus ou biopsies.

Pourquoi collaborer avec ACOBIOM ?

Collaborer avec ACOBIOM permet à ses partenaires et clients de bénéficier de :

• D’une plateforme technologique unique incluant des ressources génotypes/phénotypes multivariés,
• Plus de 20 ans d’expérience dans les analyses personnalisées pour identifier et valider les biomarqueurs ARN/ADN de différents tissus et biopsies liquides,
• Un workflow scientifique et de process approuvé/validé par la pratique clinique,
• Des outils bioinformatiques et de science des données à la pointe du progrès,
• Des méthodes et des processus d’analyse de biopsies liquides,
• Une expérience significative dans plusieurs applications de santé (cancer, infection, hématologie, neurologie, inflammation…),
• Des brevets sur des biomarqueurs pronostiques/signatures biomoléculaires prédictives,
• Plus de 60 publications scientifiques liées aux biomarqueurs, au diagnostic et à la médecine de précision,
• Un agrément « Crédit Impôt Recherche » (CIR) obtenu auprès du Ministère de la Recherche français.

Ainsi, ACOBIOM a développé, validé et mis en pratique clinique des biomarqueurs et des diagnostics basés sur son expérience et ses technologies de pointe.

Pour retrouver une synthèse des services proposés par ACOBIOM, vous pouvez télécharger ce document (en anglais).