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Les analyses d’expression de gènes par PCR en temps réel (ou qPCR) sont actuellement utilisées pour mesurer les effets des médicaments ou identifier les sous-populations de patients les plus susceptibles de bénéficier d’une thérapie spécifique. Le succès d’une expérience de qPCR repose sur la combinaison d’un triptyque unique : la sélection de gènes cibles, pertinents et régulés, l’identification d’un couple ou plus de gènes de référence, aussi appelés gènes de ménage, stables et spécifiques de l’expérience, et des analyses statistiques robustes. Ainsi, si certains considèrent les gènes cibles comme les Rois de leur expérience, les gènes de référence sont les Reines de l’équation !

ACOBIOM participe à un programme national de recherche clinique collaborative : OncoSNIPE®, dont les objectifs sont d’identifier des marqueurs précoces et tardifs de résistance aux traitements de 1ère ligne dans le cancer du sein triple négatif localement avancé ou métastatique, le cancer du poumon non à petites cellules et l’adénocarcinome canalaire pancréatique. Dans ce projet, l’équipe scientifique de la société développe un pipeline optimisé d’outils bioinformatiques et biostatistiques pour réaliser en routine, dans le sang et les tissus, des analyses d’ADN et d’ARN à partir de centaines d’expériences de séquençage.
Ce type d’approches associées à des protocoles standardisés est appliqué aux essais cliniques avec pour objectif l’identification de biomarqueurs pronostiques associés à de nouvelles thérapies.

Pour le compte d’un consortium européen, ACOBIOM a réalisé des analyses de données omiques pour renforcer l’évaluation biologique et clinique d’un dispositif médical innovant qui vise à réduire l’inflammation chronique des gencives et restaurer la santé des tissus mous de la bouche. Ces analyses de l’inflammasome tissulaire sont une reconnaissance de la plate-forme technologique de la société, de son expertise technique dans l’identification et la sélection d’un panel de biomarqueurs ARN pertinents liés à l’inflammation, ainsi que dans l’analyse biologique et statistique de données transcriptomiques.

Acobiom vient d’apporter son expertise génomique auprès d’une biotech qui développe un médicament contre l’endométriose qui touche à peu près 10% des femmes lors de leur ménorrhée.

Depuis sa création, ACOBIOM fournit des services omiques basés sur les technologies de séquençage et de PCR associées à une gamme d’outils bioinformatiques et d’algorithmes biostatistiques sélectionnés et dédiés afin de traiter et d’analyser les données génomiques et transcriptomiques.
L’objectif : identifier, sélectionner et/ou valider des biomarqueurs ADN ou ARN en corrélation avec des questions biologiques (détection de pathologies, effets de médicaments, identification de biomarqueurs, stratification de patients…), et ce quel que soit le tissu ou l’organe.

Le projet MeDIAGSTOLE vise à développer des outils de diagnostic et de pronostic pour l’insuffisance
cardiaque du ventricule gauche avec fraction d’éjection préservée (IC/FEp), une pathologie difficile à
diagnostiquer et à prendre en charge cliniquement en l’absence de traitement ciblé. Dans ce cadre,
le CHU de Montpellier et ACOBIOM ont décidé de collaborer afin d’identifier des biomarqueurs
associés à cette pathologie, et de participer ainsi à la mise en place d’une médecine personnalisée
pour les patients atteints de ce type d’insuffisance cardiaque (IC/FEp).

Contrairement à l’ADN, qui est constitué à la naissance et évolue peu au cours de la Vie, l’ARN est en constante évolution, reflétant l’état de santé général de la cellule, de l’organe et de l’organisme auquel il appartient. L’analyse de l’ARN (ou analyse de l’expression génique) est une approche particulièrement pertinente pour identifier les marqueurs biologiques (biomarqueurs) ou les cibles moléculaires associés à un processus biologique, un événement physio-pathologique, comme l’apparition ou la progression d’une maladie, les effets ou la réponse à un médicament ou un traitement. Le RNA-Seq, une approche à haut débit pour effectuer l’analyse de l’ARN par séquençage, est devenue la technologie standard pour identifier les transcrits dans les cellules et pour quantifier les gènes exprimés associés.

Le texte présenté à la conférence annuelle de l’ASCO 2021 est une synthèse de l’étude des performances cliniques du test moléculaire IVD marqué CE afin d’évaluer la réponse à la gemcitabine dans le cancer du pancréas avancé. L’adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) est hautement létal et se présente souvent à un stade avancé. La gemcitabine reste…
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Dans le cadre d’appel à projets SME Instrument-Phase 1, l’Europe a apporté son soutien financier à ACOBIOM afin d’évaluer le coût de la prise en charge actuelle du cancer du pancréas en France. Cette étude permettra de confirmer les prévisions de ventes du GemciTest en France et en Europe.