Press review


Création d’un centre de bioinformatique à Montpellier

Création d’un centre de bioinformatique à Montpellier Dans le cadre des investissements d’avenir, le gouvernement a retenu le projet IBC (Institut de Biologie Computationnelle) porté par l’Université Montpellier 2. Il sera doté de deux millions d’euros. L’objectif affiché est de créer un nouveau centre de bioinformatique pluridisciplinaire qui va développer de nouvelles méthodes et logiciels pour le traitement des grandes masses de données biologiques, avec des applications dans le domaine de la santé, l’agronomie et l’environnement.

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New prognostic markers reveal two distinct subtypes of CMML patients

New prognostic markers, determined using gene expression analyses, reveal two distinct subtypes of chronic myelomonocytic leukaemia patients.

Chronic myelomonocytic leukaemia (CMML) is a heterogeneous haematopoietic disorder characterized by myeloproliferative or myelodysplastic features. At present, the pathogenesis of this malignancy is not completely understood. In this study, we sought to analyse gene expression profiles of CMML in order to characterize new molecular outcome predictors. A learning set of 32 untreated CMML patients at diagnosis was available for TaqMan low-density array gene expression analysis. From 93 selected genes related to cancer and cell cycle, we built a five-gene prognostic index after multiplicity correction. Using this index, we characterized two categories of patients with distinct overall survival (94% vs. 19% for good and poor overall survival, respectively; P = 0·007) and we successfully validated its strength on an independent cohort of 21 CMML patients with Affymetrix gene expression data. We found no specific patterns of association with traditional prognostic stratification parameters in the learning cohort. However, the poor survival group strongly correlated with high-risk treated patients and transformation to acute myeloid leukaemia. We report here a new multigene prognostic index for CMML, independent of the gene expression measurement method, which could be used as a powerful tool to predict clinical outcome and help physicians to evaluate criteria for treatments.

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Principle considerations for the use of transcriptomics in doping research

Over the course of the past decade, technical progress has enabled scientists to investigate genome-wide RNA expression using microarray platforms. This transcriptomic approach represents a promising tool for the discovery of basic gene expression patterns and for identification of cellular signalling pathways under various conditions. Since doping substances have been shown to influence mRNA expression, it has been suggested that these changes can be detected by screening the blood transcriptome. In this review, we critically discuss the potential but also the pitfalls of this application as a tool in doping research. Transcriptomic approaches were considered to potentially provide researchers with a unique gene expression signature or with a specific biomarker for various physiological and pathophysiological conditions. Since transcriptomic approaches are considerably prone to biological and technical confounding factors that act on study subjects or samples, very strict guidelines for the use of transcriptomics in human study subjects have been developed. Typical field conditions associated with doping controls limit the feasibility of following these strict guidelines as there are too many variables counteracting a standardized procedure. After almost a decade of research using transcriptomic tools, it still remains a matter of future technological progress to identify the ultimate biomarker using technologies and/or methodologies that are sufficiently robust against typical biological and technical bias and that are valid in a court of law.

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Un projet de vaccin contre la leishmaniose

Retenu par l’Union européenne dans son programme-cadre de recherche et de développement technologique, Rapsodie associe à Virbac, BVT et Skuldtech, des équipes de recherche académique françaises, espagnoles, indiennes, tunisiennes et péruviennes. « Cette deuxième phase est une véritable avancée scientifique, précise le président du pôle, Jacquie Berthe. C’est la première fois que l’on va créer un vaccin contre un parasite chez l’homme, beaucoup plus complexe à produire qu’un vaccin contre un virus. »

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Skuldtech axe son développement sur la médecine personnalisée

En 2005, 3 millions de prescriptions aux USA, représentant un montant de 3,5 milliards de dollars, ont été estimées comme inappropriées et inefficaces (PriceWaterHouseCoopers « Personalized Medicine : The Emerging Pharmacogenomics Revolution » 2005).
En outre, pour 75% des patients atteints de cancers, une molécule donnée d’une classe thérapeutique est considérée comme inefficace (étude Ernst& Young : « Personalized Medicine Coalition », mai 2009).

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Skuldtech : de la génomique à la thérapie et au diagnostic

Skuldtech aide les acteurs des sciences de la vie à mieux comprendre les mécanismes cellulaires liés au génome et à identifier et valider les biomarqueurs spécifiques associés. « Les biomarqueurs sont des indicateurs biologiques qui renseignent sur l’état et la progression des pathologies. Ce sont d’excellents outils pour suivre l’évolution des maladies et pour déterminer l’effet ou la toxicité de nouveaux agents thérapeutiques » explique Philippe Outrebon, responsable business développement.

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